央行正着手建立一套“分账核算”系统，即自贸区内的所有企业、个人、金融机构账户都将被标识，与境内账号“隔离”；这些被标识账户的所有资金往来，央行将通过该系统实时监控。

其中一位知情人士强调，分账核算系统是独立于央行境内账户管理系统的，将是相关部门防范热钱借自贸区流入境内的一项监管措施。此外，“分账核算系统”的另一项好处便是，央行与银监会通实时时监控自贸区银行所有账户资金进出，强化流动性监管要求。

同时，相关部门开始酝酿设计一套相对独立的自贸区银行流动性监管指标。多位接近该政策的银行人士透露，基于自贸区“区内境外”的定位，目前相关部门正讨论是否引入《巴塞尔协议Ⅲ》的某些流动性监管指标，作为自贸区银行流动性监管考核标准。

《巴塞尔协议Ⅲ》在银行业金融机构杠杆率、杠杆率监控标准、贷款拨备率、拨备覆盖率、资本充足率加资本缓冲要求等流动性监管指标方面，略低于境内银行业监管要求。

知情人士表示，自贸区的所有被标识账户，原则上将被看成“境外资金”；央行等相关部门将通过分账核算系统监控被标识账户资金流向，杜绝热钱流入。考虑到部分企业在自贸区已有境内账户，不排除央行设定一个过渡期。在这个过渡期内，被标识账户资金将根据具体业务与资金周转流向，划分为境外资金与境内资金。

9月29日自贸区挂牌成立当天，工商银行、中国银行、浦发银行与上海银行纷纷设立自贸区分行。

目前，上述自贸区分行各项金融服务准备就绪，但进入操作环节，仍需相关部门出台试点金融产品清单及实施细则，并通过银行对接央行分账核算系统的验收。知情人士透露，中国银行有望率先通过验收，争取完成自贸区首单银行业务。中行人士对此不予置评。